胎儿亲子鉴定的选择主要取决于你对鉴定准确性、所需时间、安全性的需求。目前市场上有多种胎儿亲子鉴定方法，如羊水亲子鉴定、绒毛亲子鉴定和无创胎儿亲子鉴定。其中，无创胎儿亲子鉴定因为其无需手术、对孕妇和胎儿无风险的特点，受到了广泛的欢迎。至于选择哪家鉴定机构，建议选择那些经过权威部门认证、具有良好口碑和丰富经验的正规机构。

做亲子鉴定需要准备以下材料：

人员样本：可以是口腔拭子、血液、毛发等。具体采集方法可以咨询鉴定机构。

身份证明：需要提供参与鉴定人员的身份证明，如身份证、户口本等。

委托书：如果是委托他人代办，需要提供委托书。

胎儿亲子鉴定的最佳机构因地区和具体需求而异，因此很难一概而论哪家最好。通常建议选择具备相应资质和口碑的司法鉴定机构进行胎儿亲子鉴定。在进行鉴定前，需要准备的资料包括：

孕妇的有效身份证明：如身份证或护照等。

疑似父亲的有效身份证明：同样如身份证或护照等。

如果需要进行胎儿绒毛或羊水取样，可能需要提供医生的建议或相关医疗记录。

需要注意的是，在进行胎儿亲子鉴定前，建议先进行咨询，了解相关流程、费用以及所需做的准备工作。在某些情况下，医疗机构可能会要求提供额外的信息或材料。