1. 机构资质：确保选择的机构具有相关的专业资质和认证，如国家司法鉴定机构认证等。这些认证证明了机构具备进行亲子鉴定的能力和技术。

2. 技术设备：先进的设备和技术是保证亲子鉴定准确性的重要因素。因此，应选择拥有先进设备和技术的机构进行鉴定。

3. 专业团队：亲子鉴定需要专业的技术人员进行操作和分析。选择具有丰富经验和专业知识的团队进行鉴定，可以确保鉴定结果的准确性和可靠性。

在重庆地区，有多家具有专业资质和先进技术的亲子鉴定机构，如重庆西南司法鉴定所、重庆市科证司法鉴定所等。这些机构通常具有严格的操作流程和质量控制体系，能够为客户提供准确可靠的亲子鉴定服务。

需要注意的是，亲子鉴定是一种科学技术，其原理和方法是相同的，无论在哪个城市进行都应该是一样的。但是，不同的机构在实际运营和服务水平方面可能会有所不同。因此，在选择机构时，除了考虑上述因素外，还可以了解机构的服务质量、客户评价等方面的信息，以便做出更加明智的选择。